Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms