Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl3Q6W5C0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl3Q6W5C0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms