Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift172Q6VH22 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms