Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b3Q6UQ17 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b3Q6UQ17 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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