Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt9Q6RHW0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms