Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms