Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HjurpQ6PG16 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HjurpQ6PG16 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HjurpQ6PG16 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HjurpQ6PG16 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HjurpQ6PG16 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HjurpQ6PG16 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HjurpQ6PG16 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HjurpQ6PG16 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms