Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc82Q6PG04 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms