Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtifQ6PEE2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtifQ6PEE2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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