Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1cQ6PDZ2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms