Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85bQ6PDY0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms