Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sarm1Q6PDS3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sarm1Q6PDS3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms