Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RgmaQ6PCX7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms