Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Papd7Q6PB75 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Papd7Q6PB75 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms