Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms