Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smchd1Q6P5D8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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