Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrp12Q6P5B0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms