Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Podnl1Q6P3Y9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms