Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg2f1Q6P3A2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms