Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4Q6P1D7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms