Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcbtb1Q6NXM2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms