Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms