Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpsf6Q6NVF9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms