Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr44Q6NVE8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms