Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sp140Q6NSQ5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp140Q6NSQ5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms