Protein–RNA interactions for Protein: Q6J1H4

Utf1, Undifferentiated embryonic cell transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utf1Q6J1H4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utf1Q6J1H4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utf1Q6J1H4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms