Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms