Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Carmil1Q6EDY6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms