Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms