Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbf1Q6DFZ1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbf1Q6DFZ1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbf1Q6DFZ1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbf1Q6DFZ1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms