Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Msl2Q69ZF8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msl2Q69ZF8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms