Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
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