Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms