Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CltcQ68FD5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CltcQ68FD5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms