Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3ipQ68EF0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 305 ms