Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrp4eQ66X19 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms