Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CilpQ66K08 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms