Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC080695Q66JY9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC080695Q66JY9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms