Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna3Q65CL1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms