Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp9Q64HY3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp9Q64HY3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp9Q64HY3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp9Q64HY3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp9Q64HY3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp9Q64HY3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Sp9Q64HY3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp9Q64HY3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp9Q64HY3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp9Q64HY3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp9Q64HY3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sp9Q64HY3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sp9Q64HY3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sp9Q64HY3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sp9Q64HY3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp9Q64HY3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sp9Q64HY3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp9Q64HY3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sp9Q64HY3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp9Q64HY3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sp9Q64HY3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sp9Q64HY3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sp9Q64HY3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp9Q64HY3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sp9Q64HY3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp9Q64HY3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp9Q64HY3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sp9Q64HY3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp9Q64HY3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sp9Q64HY3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp9Q64HY3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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