Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf2Q64705 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf2Q64705 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms