Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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PtprdQ64487 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PtprdQ64487 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PtprdQ64487 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PtprdQ64487 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PtprdQ64487 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PtprdQ64487 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PtprdQ64487 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PtprdQ64487 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprdQ64487 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms