Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Irf4Q64287 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Irf4Q64287 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Irf4Q64287 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Irf4Q64287 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Irf4Q64287 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Irf4Q64287 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Irf4Q64287 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Irf4Q64287 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf4Q64287 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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