Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6eQ64253 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly6eQ64253 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly6eQ64253 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly6eQ64253 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly6eQ64253 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly6eQ64253 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly6eQ64253 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly6eQ64253 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly6eQ64253 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly6eQ64253 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly6eQ64253 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms