Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim24Q64127 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms