Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pan3Q640Q5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms