Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PatjQ63ZW7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms