Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm20917Q62457 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm20917Q62457 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Gm20917Q62457 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Gm20917Q62457 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Gm20917Q62457 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Gm20917Q62457 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Gm20917Q62457 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Gm20917Q62457 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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Gm20917Q62457 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gm20917Q62457 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20917Q62457 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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