Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms