Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpd52Q62393 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms